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罠は、別の罠に繋がる。
これは、関係者しか読めない資料なのでは?
しおりを挟むP.,
Tomlinson,C., Chen,J., Wollam,A., Pepin,K.H., Bhonagiri,V.,
Zhang,X., Suruliraj,S., Warren,W., Mitreva,M., Mardis,E.R. and
Wilson,R.K.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (19-APR-2012) Genome Sequencing Center, Washington
University School of Medicine, 4444 Forest Park, St. Louis, MO
63108, USA
COMMENT REFSEQ INFORMATION: The reference sequence was derived from
JH813970.
Enterococcus faecium 509 is a member of the Firmicutes division of
the domain Bacteria.
This is a reference genome for the Human Microbiome Project. This
project is co-owned with the Human Microbiome Project DACC.
Bacteria was provided by Dan Sahm, PhD, Chief Scientific Officer,
Global Infectious Diseases Services, and Chris Pillar, PhD, Senior
Scientist (Eurofins Global Central Laboratory, 14100 Park Meadow
Drive, Chantilly, VA 20151 USA). Source DNA was provided by Cesar
A. Arias, MD, MSc, PhD (Associate Professor of Medicine, Division
of Infectious Diseases, Director, Laboratory for Antimicrobial
Research, University of Texas Medical School at Houston, MSB 2.112,
6431 Fannin, Houston, TX 77030, USA). Funded by NIH R01 from the
Division of Microbiology and Infectious Diseases, NIAID
Coding sequences were predicted using GeneMark v3.3 and Glimmer3
v3.02. Intergenic regions not spanned by GeneMark and Glimmer3 were
blasted against NCBI's non-redundant (NR) database and predictions
generated based on protein alignments. tRNA genes were determined
using tRNAscan-SE 1.23 and non-coding RNA genes by RNAmmer-1.2 and
Rfam v8.1. The final gene set is processed through several programs
such as Kegg (Release 56), psortB (Version 3.0.3) and Interproscan
(Version 4.7) to determine possible function. Gene product names
are determined by BER (Version 2.5). Gene names are generated at
the contig level and may not necessarily reflect any known order or
orientation between contigs.
P.、
Tomlinson、C.、Chen、J.、Wollam、A.、Pepin、K.H.、Bhonagiri、V。、
Zhang、X.、Suruliraj、S.、Warren、W.、Mitreva、M.、Mardis、E.R。そして
Wilson、R.K。
タイトル直接提出
ジャーナル提出(2012年4月19日)ワシントンのゲノムシーケンシングセンター
大学医学部、4444フォレストパーク、セントルイス、ミズーリ州
63108、米国
コメント参照配列情報:参照配列は
JH813970。
Enterococcus faecium 509は、のFirmicutes部門のメンバーです。
ドメインバクテリア。
これは、ヒトマイクロバイオームプロジェクトのリファレンスゲノムです。この
プロジェクトは、Human Microbiome ProjectDACCと共同所有されています。
バクテリアは、最高科学責任者のダン・サーム博士から提供されました。
グローバル感染症サービス、およびクリスピラー博士、シニア
科学者(Eurofins Global Central Laboratory、14100 Park Meadow
ドライブ、シャンティリー、バージニア州20151米国)。
ソースDNAはCesarによって提供されました
A. Arias、MD、MSc、PhD(医学部准教授
感染症研究所、抗菌研究所所長
テキサス大学ヒューストン医科大学、MSB 2.112、
6431 Fannin、Houston、TX 77030、USA)。からNIHR01によって資金提供
微生物学および感染症部門、NIAID
コーディング配列は、GeneMarkv3.3およびGlimmer3を使用して予測されました
v3.02。 GeneMarkとGlimmer3にまたがらない遺伝子間領域は
NCBIの非冗長(NR)データベースと予測に対して爆破
タンパク質のアラインメントに基づいて生成されます。 tRNA遺伝子が決定された
tRNAscan-SE1.23およびRNAmmer-1.2による非コードRNA遺伝子の使用および
Rfamv8.1。最終的な遺伝子セットは、いくつかのプログラムを通じて処理されます
Kegg(リリース56)、psortB(バージョン3.0.3)、Interproscanなど
(バージョン4.7)可能な機能を決定します。遺伝子産物名
BER(バージョン2.5)によって決定されます。遺伝子名はで生成されます
コンティグレベルであり、必ずしも既知の順序を反映しているとは限りません。
コンティグ間の向き。
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