🌟真理の扉

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第183章　　懲りもせず、新しい世界に向けて

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Enterococcus.
REFERENCE   1  (bases 1 to 64591)
  AUTHORS   Weinstock,G., Sodergren,E., Lobos,E.A., Fulton,L., Fulton,R.,
            Courtney,L., Fronick,C., O'Laughlin,M., Godfrey,J., Wilson,R.M.,
            Miner,T., Farmer,C., Delehaunty,K., Cordes,M., Minx,P.,
            Tomlinson,C., Chen,J., Wollam,A., Pepin,K.H., Bhonagiri,V.,
            Zhang,X., Suruliraj,S., Warren,W., Mitreva,M., Mardis,E.R. and
            Wilson,R.K.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (19-APR-2012) Genome Sequencing Center, Washington
            University School of Medicine, 4444 Forest Park, St. Louis, MO
            63108, USA
COMMENT     REFSEQ INFORMATION: The reference sequence was derived from
            JH813970.
            Enterococcus faecium 509 is a member of the Firmicutes division of
            the domain Bacteria.

            This is a reference genome for the Human Microbiome Project. This
            project is co-owned with the Human Microbiome Project DACC.

            Bacteria was provided by Dan Sahm, PhD, Chief Scientific Officer,
            Global Infectious Diseases Services, and Chris Pillar, PhD, Senior
            Scientist (Eurofins Global Central Laboratory, 14100 Park Meadow
            Drive, Chantilly, VA 20151 USA).  Source DNA was provided by Cesar
            A. Arias, MD, MSc, PhD (Associate Professor of Medicine, Division
            of Infectious Diseases, Director, Laboratory for Antimicrobial
            Research, University of Texas Medical School at Houston, MSB 2.112,
            6431 Fannin, Houston, TX 77030, USA).  Funded by NIH R01 from the
            Division of Microbiology and Infectious Diseases, NIAID

            Coding sequences were predicted using GeneMark v3.3 and Glimmer3
            v3.02. Intergenic regions not spanned by GeneMark and Glimmer3 were
            blasted against NCBI's non-redundant (NR) database and predictions
            generated based on protein alignments. tRNA genes were determined
            using tRNAscan-SE 1.23 and non-coding RNA genes by RNAmmer-1.2 and
            Rfam v8.1. The final gene set is processed through several programs
            such as Kegg (Release 56), psortB (Version 3.0.3) and Interproscan
            (Version 4.7) to determine possible function. Gene product names
            are determined by BER (Version 2.5). Gene names are generated at
            the contig level and may not necessarily reflect any known order or
            orientation between contigs.

            The National Human Genome Research Institute (NHGRI), National
            Institutes of Health (NIH) is funding the sequence characterization
            of the Enterococcus faecium 509 genome.
            The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation
            Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here:
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/

腸球菌。

参照1（ベース1から64591）

  著者Weinstock、G.、Sodergren、E.、Lobos、E.A.、Fulton、L.、Fulton、R。、
            Courtney、L.、Fronick、C.、O'Laughlin、M.、Godfrey、J.、Wilson、R.M。、
            Miner、T.、Farmer、C.、Delehaunty、K.、Cordes、M.、Minx、P。、
            Tomlinson、C.、Chen、J.、Wollam、A.、Pepin、K.H.、Bhonagiri、V。、
            Zhang、X.、Suruliraj、S.、Warren、W.、Mitreva、M.、Mardis、E.R。そして
            Wilson、R.K。
  タイトル直接提出
  ジャーナル提出（2012年4月19日）ワシントンのゲノムシーケンシングセンター
            大学医学部、4444フォレストパーク、セントルイス、ミズーリ州
            63108、米国
コメント参照配列情報：参照配列は
            JH813970。
            Enterococcus faecium 509は、のFirmicutes部門のメンバーです。
            ドメインバクテリア。

            これは、ヒトマイクロバイオームプロジェクトのリファレンスゲノムです。この
            プロジェクトは、Human Microbiome ProjectDACCと共同所有されています。

            バクテリアは、チーフサイエンティフィックオフィサーのダンサーム博士から提供されました。
            グローバル感染症サービス、およびクリスピラー博士、シニア
            科学者（Eurofins Global Central Laboratory、14100 Park Meadow
            ドライブ、シャンティリー、バージニア州20151米国）。ソースDNAはCesarによって提供されました
            A. Arias、MD、MSc、PhD（医学部准教授
            感染症研究所、抗菌研究所所長
            テキサス大学ヒューストン医科大学、MSB 2.112、
            6431 Fannin、Houston、TX 77030、USA）。からNIHR01によって資金提供
            微生物学および感染症部門、NIAID

            コーディング配列は、GeneMarkv3.3およびGlimmer3を使用して予測されました
            v3.02。 GeneMarkとGlimmer3にまたがらない遺伝子間領域は
            NCBIの非冗長（NR）データベースと予測に対して爆破
            タンパク質のアラインメントに基づいて生成されます。 tRNA遺伝子が決定された
            tRNAscan-SE1.23およびRNAmmer-1.2による非コードRNA遺伝子の使用および
            Rfamv8.1。最終的な遺伝子セットは、いくつかのプログラムを通じて処理されます
            Kegg（リリース56）、psortB（バージョン3.0.3）、Interproscanなど
            （バージョン4.7）可能な機能を決定します。遺伝子産物名
            BER（バージョン2.5）によって決定されます。遺伝子名はで生成されます
            コンティグレベルであり、必ずしも既知の順序を反映しているとは限りません。
            コンティグ間の向き。

            国立ヒトゲノム研究所（NHGRI）、国立
            Institutes of Health（NIH）は、シーケンスの特性評価に資金を提供しています
            エンテロコッカスフェシウム509ゲノムの。
            注釈はNCBI原核生物ゲノム注釈によって追加されました
            パイプライン（PGAP）。 PGAPに関する情報はここにあります：
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/

バイオテクノロジーの分野において、知識のある方は、細かく査定して頂けたらありがたい。

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