海が攻めてくる〜神隠しにあった俺は、異世界日本の戦国時代で、海から這い出る『物の怪』達から異世界日本を護ります〜

ある日の帰り道、高校2年生の楠木隆之介は異世界日本に辿り着く。それはいわゆる神隠しというものだろう。

その世界の日本は海の脅威に晒されていた。海からは日々「物の怪」と呼ばれる化物どもが出現し、土地を食い荒らしていくのだ。物の怪どもに負けた土地は海に沈み、全てが奪われる。そのために人々は海岸に城や城壁、防塁を築きこれに対抗していた。

だが、上格と呼ばれる物の怪には侍や足軽では抵抗できず、それらを討伐するための特殊な力を持つ英雄達が存在した。彼らは神将と尊敬され、その最上位にいるのが十二神将と呼ばれる強者達だった。

神隠しによって異世界日本に来てしまった楠木は、同じく神隠しにあった仲間達ともに、元の世界に帰るため、愛する者を守るため、神将のみが持つ特殊な力を持って、この世界で物の怪達を討伐するのであった。