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地球温暖化により海面が上昇し各地の沿岸や低地の島は海中に没する。 没した海域の住民は生業を失い次々と船を襲う海賊となり、海の治安は人類史上最悪となった。　 人々は増え続ける海賊対策ととも、海中に没した島の人々に居住と雇用を確保するため巨大港湾都市を建設し、問題を解決する事が話し合われる。 四方海に囲まれ、沿岸の侵食が著しい和国が魁となってプロジェクトを立ち上げることになった。 プロジェクトは居住と雇用だけではなく、海洋環境の改善も盛り込まれ、これ以上の温暖化を海洋環境の改善で食い止めたいという希望が託された。 プロジェクトが立ち上がり100年後、海上都市はオーシャンエッジと名付けられ、海中に没した島の人のみならず、世界中から人々が集まり着々と拡大ブロックを連結し巨大化していく。 そんな中、ある研究が発表された。人類の混血が進みある閾値を超えると特異な能力が出現する可能性があるという論文だった。 オーシャンエッジはその舞台に選定され世界中の人々の混血を進める施策が取られる事となる。 その論文、ジェネ・フュージョン理論を発表した島田健太郎教授が研究成果を携えオーシャンエッジへと向う。 未だ海賊が跋扈し、貨物船を襲う事件があとを絶たない。 教授は果たして無事オーシャンエッジにたどり着けるのだろうか？

夏休み。考古学者の娘、さつきは父がマチュ・ピチュで発掘した展示物を見に友人と出掛ける。 黄金に輝く装飾品の中、一人の女の子のミイラが展示してあった。 さつきは恐る恐る覗き込むと高貴な民族衣裳で身を包む干からびた女の子が横たわっていた。 「ワタ…ツキミ…ウ」ふとか細い呟きが聞こえる。 ごく普通の少女に起きる夏休みの不思議な物語